獨家 | 用時最短!中國學者突破100篇CNS生命科學領域成果;高福/饒子和/秦川都大于4篇;上??萍即髮W及山東農業大學表現出色
iNature · 2020/07/28
截止2020月7月27日,中國學者在Cell,Nature 及Science 發表了共計102項生命科學的研究成果。

本文轉載自“iNature”微信公眾號。

截止2020月7月27日,中國學者在Cell,Nature 及Science 發表了共計102項生命科學的研究成果,其中新冠肺炎領域占了近一半(共43篇)。iNature系統總結了這些研究成果:

按雜志來劃分:Cell 發表了30篇,Nature 發表了45篇,Science 發表了27篇;

按是否有合作單位劃分:其中有37篇文章由獨立的一個通訊單位完成,65篇是多單位共同通訊完成的,其中有27篇是中外多單位共同通訊完成的,38篇是國內多單位共同通訊完成;

按單位來劃分(文章數目大于5):中國科學院34篇,清華大學14篇,上??萍即髮W11篇,復旦大學8篇,中國醫學科學院7篇,北京大學6篇,香港大學6篇;

按通訊作者來分(大于3篇CNS):饒子和6篇,秦川6篇,高福5篇,王佑春3篇,邵峰3篇,武桂珍3篇,秦成峰3篇等;

最后,由于文章較多,如有錯誤,請及時向iNature反映,方便我們進一步糾正。

1.截至2020年7月27日,中國學者在CNS發表了102篇文章,具體的單位列表如下:


2.文章列表如下(紅色字體的為新冠領域相關的文章):


3.所有文章解析列表:

【1】2020年1月1日,中國農業大學李云開及密歇根州立大學Liu Jianguo共同通訊在Nature 在線發表題為“Assessing progress towards sustainable development over space and time”的研究論文,該研究開發和測試系統的方法,以量化中國在國家和國家以下各級實現17個SDG的進展??偠灾?,這項研究提供了國家和國家以下各級所有17個可持續發展目標的時間可持續性評估。 因此,本文概述的方法對中國的監測工作具有價值。 該方法也可能為分析其他國家以及地方乃至全球層面的可持續發展目標進展的時空模式奠定基礎。最后,該文章被選為最新一期Nature 的封面文章;

【2】2020年1月15日,同濟大學戈寶學及上??萍即髮W饒子和共同通訊在Nature 在線發表題為“Host-mediated ubiquitination of a mycobacterial protein suppresses immunity”的研究論文,該研究發現宿主E3泛素連接酶ANAPC2(后期促進復合物/環體的核心亞基)與分枝桿菌蛋白Rv0222相互作用,并促進賴氨酸11連接的泛素鏈對Rv0222的賴氨酸76的附著,從而抑制促炎細胞因子的表達??偠灾?,該研究發現確定了結核分枝桿菌用來抑制宿主免疫力的一種以前未被認識的機制,并提供了與開發針對結核分枝桿菌的有效免疫調節劑有關的見解。

【3】2020年1月15日,中國科學院生物物理研究所王曉群及北京師范大學吳倩共同通訊在Nature 在線發表題為“Decoding the development of the human hippocampus”的研究論文,該研究使用單細胞RNA測序,并通過測序(ATAC–seq)分析來測定轉座酶可接近的染色質,以說明發育中的人類海馬的細胞類型,細胞線性,分子特征和轉錄調控??偠灾?,這些數據為了解人類海馬的發育提供了藍圖,也為調查相關疾病提供了工具。

【4】2020年1月16日,芝加哥大學何川,中國科學院北京基因組研究所韓大力及同濟大學高亞威共同通訊在Science 在線發表題為“N6-methyladenosine of chromosome-associated regulatory RNA regulates chromatin state and transcription”的研究論文,該研究表明在小鼠胚胎干細胞中敲除m6A催化蛋白Mettl3或核識別蛋白Ythdc1會增加染色質的可及性,并以m6A依賴性方式激活轉錄。該研究發現METTL3在染色體相關的調控RNA(carRNA)上沉積了m6A修飾,包括啟動子相關的RNA,增強子RNA和重復RNA。 總的來說,該研究結果表明,carRNA上的m6A可以全局調節染色質狀態和轉錄。

【5】哺乳動物SWI / SNF家族的染色質重塑蛋白BAF和PBAF調節染色質的結構和轉錄,其突變與癌癥有關。2020年1月30日,復旦大學徐彥輝團隊在Science 在線發表題為“Structure of nucleosome-bound human BAF complex”的研究論文,該研究獲得了3.7?分辨率的核小體結合的人BAF的冷凍EM結構,揭示了核小體被堿基和ATPase模塊夾在中間,后者被肌動相關蛋白(ARP)模塊橋接。該研究為人類BAF復合物的亞基組織和核小體識別提供了結構上的見識。

【6】選擇性靶向CB2的藥物有望治療神經退行性疾病,炎癥和疼痛,同時避免CB1介導的精神副作用。對CB2激活和信號轉導的機制了解甚少,但對藥物設計至關重要。2020年1月30日,中科院上海藥物所徐華強等在Cell 在線發表題為“Cryo-EM Structure of the Human Cannabinoid Receptor CB2-Gi Signaling Complex”的研究論文,該研究報告了綁定到激動劑WIN 55,212-2的人類CB2-Gi信號復合物的冷凍EM結構。3D結構揭示了WIN 55,212-2的結合模式和用于將CB2激動劑與拮抗劑區分開的結構決定簇。具有計算對接結果的進一步結構分析揭示了CB2和CB1之間在受體激活,配體識別和Gi耦合方面的差異。這些發現有望促進針對大麻素系統的藥物的發現。

【7】2020年1月30日,上??萍即髮W劉志杰及華甜共同通訊在Cell 在線發表題為“Activation and Signaling Mechanism Revealed by Cannabinoid Receptor-Gi Complex Structures”的研究論文,該研究揭開了大麻素受體CB1和CB2分別處于拮抗狀態、中間態及激活態的神秘面紗,對大麻素系統的認知又邁出了堅實的一大步。同時,該研究還揭示了CB2受體獲得高選擇性配體的分子機制,為針對CB2的免疫類新藥設計提供了更加精確的分子模型和理論基礎。

【8】2020年1月30日,北京大學湯富酬與中國科學院動物研究所劉光慧、曲靜、美國索爾克(Salk)研究所Juan Carlos Izpisua Belmonte共同通訊在Cell在線發表題為“Single-Cell Transcriptomic Atlas of Primate Ovarian Aging“的研究論文(封面文章),該研究利用高精度單細胞轉錄組測序技術首次繪制了食蟹猴卵巢的單細胞衰老圖譜,同時利用人類卵巢細胞研究體系,發現增齡伴隨的抗氧化能力的下降是靈長類卵巢衰老的主要特征之一。

【9】福建農林大學張亮生團隊題為“The water lily genome and the early evolution of flowering plants”的研究論文。該研究獲得了藍星睡蓮的高質量基因組,并通過其基因組與轉錄組結果展示了早期被子植物的進化特點和特征;同時解析了睡蓮的花器官發育和花香花色調控基因,對園藝植物分子育種等應用具有重要參考價值。

【10】2020年2月3日,復旦大學張永振團隊在Nature 在線發表題為“A new coronavirus associated with human respiratory disease in China”的研究論文,該研究報告了一名在海鮮市場上工作的患者,該患者于2019年12月26日入住武漢市中心醫院,患有嚴重的呼吸系統綜合癥,包括發燒,頭暈和咳嗽。支氣管肺泡灌洗液樣品的基因組RNA測序,鑒定了一種新型的RNA冠狀病毒,在此稱為為WH-Human-1冠狀病毒(也是后面稱為的2019-CoV)。對完整病毒基因組(29,903個核苷酸)的系統進化分析表明,該病毒與一組SARS樣冠狀病毒最相似(89.1%核苷酸相似性)。2019-nCoV和SARS-CoV RBD結構域之間氨基酸序列的高度相似性和預測的蛋白質結構表明,2019-nCoV可能有效地利用人ACE2作為細胞進入受體,潛在地促進了人與人之間的傳播。2019-nCoV與蝙蝠冠狀病毒最密切相關,甚至在nsp7和E蛋白中與Bat-SL-CoVZC45表現出100%的氨基酸相似性。 因此,這些數據表明蝙蝠可能是2019-nCoV的宿主。 但是,由于首次報告該病時市場上有多種動物在出售,因此需要更多的工作來確定2019-nCoV的天然宿主和中間宿主。

【11】2020年2月3日,中國科學院武漢病毒所石正麗團隊在Nature 在線發表題為“A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin”的研究論文,該認為蝙蝠才是最有可能的攜帶2019-nCoV病毒的野生動物。

【12】2020年2月6日,北京大學肖俊宇團隊在Science 發表題為“Structural insights into immunoglobulin M”的研究論文,該研究報道了與J鏈和pIgR胞外域復合的人IgM Fc區的冷凍電子顯微鏡結構。IgM-Fc五聚體不對稱形成,類似于帶有缺失三角形的六邊形。IgM-Fc的尾巴包裝成淀粉樣結構以穩定五聚體。J鏈封住尾翼組件,并橋接IgM-Fc與pIgR之間的相互作用,該相互作用經歷了較大的構象變化,從而與IgM–J復合物接合。 這些結果為IgM的功能提供了結構基礎。

【13】2020年2月6日,浙江大學王朗及谷巖共同通訊在Science 發表題為“Microglia mediate forgetting via complement-dependent synaptic elimination”的研究論文,該研究報道了健康成年小鼠海馬中的小膠質細胞吞噬了突觸成分。小膠質細胞的減少或小膠質細胞吞噬作用的抑制可防止遺忘和“印記”細胞的分離。 通過引入CD55抑制補體途徑,特別是在engram細胞中,該研究進一步證明了小膠質細胞以補體和活性依賴性方式調節遺忘。此外,小膠質細胞參與神經發生相關和神經發生無關的記憶退化。 在一起,該研究結果表明小膠質細胞依賴補體的突觸消除是潛在的遺忘遠程記憶的機制。

【14】2020年2月6日,中國科學院遺傳發育所傅向東及牛津大學Nicholas P. Harberd共同通訊在Science 發表題為“Enhanced sustainable green revolution yield via nitrogen-responsive chromatin modulation in rice”的研究論文,該研究發現氮狀態通過組蛋白的修飾影響染色質功能,在該過程中,轉錄因子NGR5將PRC2募集到目標基因。這些基因中的一些調控分蘗,例如,隨著氮含量的增加,植物將產生更多的分蘗。NGR5由蛋白酶體破壞調節并介導激素信號傳導。NGR5水平的增加可以推動水稻分蘗和產量的增加,而無需增加富氮肥料。

【15】2020年2月19日,上??萍即髮W徐菲,上海交通大學雷鳴和武健共同通訊在Nature 在線發表題為“Structural basis of ligand recognition and self-activation of orphan GPR52”的研究論文,該研究介紹了人類GPR52在無配體和Gs耦合狀態下的高分辨率結構。結構表明,細胞外環2占據了正構結合袋,并作為內置的激動劑起作用,賦予GPR523高水平的基礎活性。當在沒有外部激動劑的情況下將Gs偶聯至GPR52時,將達到完全激活狀態。該受體還具有配體結合的側袋。對GPR52的結構和功能的這些見解可以增進我們對其他自激活GPCR的理解,能夠鑒定內源和工具配體,并指導靶向GPR52的藥物發現工作。

【16】2020年2月19日,清華大學隋森芳院士團隊在Nature 在線發表題為“Structural basis of energy transfer in Porphyridium purpureum phycobilisome”的研究論文,該研究報道了來自Porphyridium purpureum的14.7MDa藻膽體的半電子體形狀的冷凍電子顯微鏡結構。該模型揭示了接頭蛋白如何影響發色團的微環境,并表明接頭蛋白的芳香氨基酸與發色團的相互作用可能是微調發色團能量狀態的轉移以確保有效單向的關鍵因素。

【17】2020年2月21日,復旦大學陸路及哈佛大學Mei X. Wu共同通訊在Science 在線發表題為“Pulmonary surfactant–biomimetic nanoparticles potentiate heterosubtypic influenza immunity”的研究論文,該研究合成了包裹2',3'-環鳥苷一磷酸-腺苷一磷酸(cGAMP)的肺表面活性劑(PS)-仿生脂質體。佐劑(PS-GAMP)通過模擬病毒感染的早期階段而不會伴隨過度炎癥,從而大大增強了流感疫苗誘導的小鼠體液和CD8 + T細胞免疫應答。經PS-GAMP佐劑的H1N1疫苗鼻內免疫后兩天,針對遠處的H1N1和異型H3N2,H5N1和H7N9病毒,至少維持了6個月的交叉保護,同時維持了肺部駐留記憶CD8 + T細胞。然后在雪貂中驗證佐劑的功效:當缺少Sting的肺泡上皮細胞(AEC)或間隙連接被阻斷時,體內PS-GAMP介導的佐劑作用被基本消除。因此,AEC在配置異型免疫中起著關鍵作用。

【18】2020年2月26日,中國科學院上海神經生物研究所蔡時青及巴斯德研究所江陸斌共同通訊在Nature 在線發表題為“Two conserved epigenetic regulators prevent healthy ageing”的研究論文,該研究讓我們看到了實現“健康老齡化”的可能。該研究在秀麗隱桿線蟲中的全基因組RNA干擾篩選揭示了衰老的保守的表觀遺傳負調節蛋白,提示了實現健康衰老的可能方法。

【19】2020年2月27日,NIBS的邵峰及中國科學院生物物理研究所丁璟珒共同通訊在Cell 在線發表題為“Structural Mechanism for GSDMD Targeting by Autoprocessed Caspases in Pyroptosis”的研究論文,該研究顯示了產生p10產物的特定于位點的caspase-4 / 11自動加工,對于裂解GSDMD和誘導焦亡是必需的和足夠的??偠灾?,該研究揭示了胱天蛋白酶的前所未有的底物靶向機制。疏水界面為開發對焦磷酸半胱氨酸蛋白酶特異性的抑制劑提供了額外的空間。

【20】2020年2月27日,中國科學院動物研究所劉光慧,曲靜,中國科學院北京基因組研究所張維綺及Salk研究所Juan Carlos Izpisua Belmonte共同通訊在Cell 在線發表題為“Caloric Restriction Reprograms the Single-Cell Transcriptional Landscape of Rattus Norvegicus Aging”的研究論文,該研究跨經歷衰老和CR的各種大鼠組織建立了全面的單細胞轉錄組圖譜該研究工作提供了與哺乳動物衰老和CR相關的多組織單細胞轉錄環境,加深了我們對CR作為強力保護性干預的了解,并揭示了代謝干預如何作用于免疫系統以改變衰老過程。

【21】2020年3月4日,西湖大學周強團隊在Science在線發表題為“Structural basis for the recognition of the SARS-CoV-2 by full-length human ACE2”的研究論文,該研究利用冷凍電鏡技術成功解析了此次新冠病毒的受體——ACE2的全長結構,這是世界上首次解析出ACE2的全長結構。

【22】2020年3月5日,中山大學蘇士成團隊在Cell 在線發表題為“Complement Signals Determine Opposite Effects of B Cells in Chemotherapy-Induced Immunity”的研究論文,該研究通過在乳腺癌新輔助化療前后的患者縱向樣本中對B細胞異質性進行單細胞解剖,發現ICOSL+ B細胞亞群在化療后出現??偠灾?,該研究表明腫瘤治療重塑了腫瘤中B細胞,并揭示了補體在B細胞依賴性抗腫瘤免疫中的新作用。 同樣重要的是,該研究建議CD55作為增強免疫原性化療功效的有吸引力的治療靶標。

【23】2020年3月11日,NIBS邵峰及北京大學劉志博共同通訊在Nature 在線發表題為“A bioorthogonal system reveals antitumour immune function of pyroptosis”的研究論文,該研究建立了一個生物正交化學系統,在該系統中,癌癥成像探針苯丙氨酸三氟硼酸酯(Phe-BF3)可以進入細胞,使其去甲硅烷基化并“裂解”包含甲硅烷基醚的設計連接子?;赑he-BF3脫甲硅烷基的生物正交系統是化學生物學的強大工具。該研究在該系統上的應用表明,熱解誘導的炎癥觸發了強大的抗腫瘤免疫力,并且可以與檢查點封鎖協同作用。

【24】2020年3月11日,清華大學沈曉驊及尹亞飛共同通訊在Nature 在線發表題為“U1 snRNP regulates chromatin retention of noncoding RNAs”的研究論文,該研究描述了一種隨機,誘變耦合,高通量的方法(mutREL-seq)。該研究揭露了U1 snRNP在前體mRNA加工之外的先前未知的作用,并為如何將lncRNAs募集到調節位點以執行與染色質相關的功能提供了分子見解。

【25】2020年3月12日,中國科學院植物研究所張立新團隊在Cell 在線發表題為“Liquid-Liquid Phase Transition Drives Intra-chloroplast Cargo Sorting”的研究論文,該研究確定了兩個擬南芥錨蛋白STT1和STT2,它們專門介導葉綠體雙精氨酸易位(cpTat)途徑蛋白到類囊體膜的分選。STT1和STT2通過其C末端錨蛋白域的相互作用形成獨特的異二聚體。cpTat底物與STT絡合物的N端固有無序區的結合引起液-液相分離。因此,相分離液滴的形成作為葉綠體內蛋白分揀的新機制出現。該研究的發現突出了調節細胞器生物發生的相分離的保守機制。

【26】2020年3月18日,中國科學院微生物研究所高福及施一共同通訊在Nature 在線發表題為“Structural insight into arenavirus replication machinery”的研究論文,該研究報告Lassa乳腺病毒(LASV)和Machupo乳腺病毒(MACV)天然狀態和啟動子綁定形式的聚合酶的近原子分辨率結構。這些發現將有助于更好地理解RNA病毒復制,并為抗病毒藥物設計指明新的候選靶標。

【27】2020年3月20日,中科院上海藥物所吳蓓麗,趙強,中科院生物物理所孫飛及復旦大學Denise Wootten共同通訊在Science 在線發表題為“Structural basis of Gs and Gi recognition by the human glucagon receptor”的研究論文,該研究使用冷凍電子顯微鏡,確定了與胰高血糖素結合的人胰高血糖素受體(GCGR)的結構以及不同類別的異源三聚體G蛋白,Gs或Gi1。這些結構與藥理學數據相結合,為GCGR激活,多效性偶聯和G蛋白特異性提供了重要見識。

【28】2020年3月19日,中科院上海生化細胞所曾藝團隊在Cell 在線發表題為“Long-Term Expansion of Pancreatic Islet Organoids from Resident Procr+ Progenitors”的研究論文,該研究通過單細胞RNA測序(scRNA-seq)在成年小鼠胰腺中鑒定了先前未知的蛋白C受體陽性(Procr +)細胞群體。這些發現表明,成年小鼠胰腺胰島含有一定數量的Procr +內分泌祖細胞。

【29】2020年3月19日,Nature 雜志在線發表了山東農業大學與美國馬薩諸塞大學阿默斯特分校共同完成題為“FERONIA controls pectin- and nitric oxidemediated male–female interaction”的研究論文。該研究經過長期努力,成功揭示了被子植物阻止多個花粉管進入胚珠的分子機制。

【30】2020年3月25日,中國科學院微生物研究所嚴景華及齊建勛共同通訊在Cell 在線發表題為“Structural and functional basis of SARS-CoV-2 entry by using human ACE2”的研究論文,該研究利用免疫染色和流式細胞儀檢測,確定S1 CTD(SARS-CoV-2-CTD)為SARS-CoV-2中與hACE2受體相互作用的關鍵區域。隨后解決了與hACE2結合的SARS-CoV-2-CTD的2.5?晶體結構,該結構揭示了總體上與SARS-CoV RBD(SARS-RBD)相似的受體結合模式。這些數據闡明了病毒的進入和致病機理,并有望激發針對這種新興病原體的新型靶向治療。

【31】2020年3月25日,海軍軍醫大學孫穎浩,高旭及圣路易斯華盛頓大學王艇共同通訊在Nature 在線發表題為“A genomic and epigenomic atlas of prostate cancer in Asian populations”的研究論文,該研究產生并分析了來自中國原發性前列腺癌患者的208份腫瘤組織樣品和匹配的健康對照組織的全基因組,轉錄組和DNA甲基化數據。這些發現強調了在構建疾病綜合基因組圖譜時納入種群背景的重要性。

【32】2020年3月25日,清華大學史航及時松海共同通訊在Nature 在線發表題為“Centrosome anchoring regulates progenitor properties and cortical formation”的研究論文,該研究在小鼠中顯示,將中心體錨定到頂膜可控制皮質RGP的機械性能,從而控制其有絲分裂行為以及皮質的大小和形成??傊?,這些結果表明中心體在調節神經祖細胞的特征以及哺乳動物大腦皮層的大小和構型方面的作用。

【33】 2020年3月25日,浙江大學郭國驥及韓曉平共同通訊在Nature 在線發表題為“Construction of a human cell landscape at single-cell level”的研究論文,該研究使用單細胞mRNA測序來確定所有主要人體器官的細胞類型組成,并構建了針對人類細胞景觀(HCL)的方案。該研究揭示了尚未被很好表征的許多組織的單細胞層次結構。該研究為人類生物學提供了寶貴的資源。

【34】2020年3月25日,廈門大學韓家淮及莫瑋共同通訊在Nature 在線發表題為“Gut stem cell necroptosis by genome instability triggers bowel inflammation”的研究論文,該研究報道SETDB1,組氨酸甲基轉移酶介導組蛋白H3在賴氨酸9的三甲基化的缺乏參與IBD的發病機理。

【35】2020年3月26日,香港大學管軼和廣西醫科大學胡艷玲共同通訊在Nature 在線發表題為“Identifying SARS-CoV-2 related coronaviruses in Malayan pangolins”的研究論文,該研究對廣西和廣東反走私行動中查獲的多個穿山甲樣本進行檢測,并在穿山甲樣本中發現了冠狀病毒,屬于此次新冠病毒的兩個亞型,其中一個受體結合域與新冠病毒密切相關。穿山甲冠狀病毒的多個譜系及其與SARS-CoV-2的相似性的發現表明,穿山甲應被視為新型冠狀病毒出現的可能宿主,該研究再次強調應禁止交易穿山甲等野生動物。

【36】2020年3月30日,清華大學王新泉及張林琦共同通訊在Nature 在線發表題為“Structure of the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound to the ACE2 receptor”的研究論文,該研究解析了新冠病毒刺突蛋白受體結合結構域與人受體蛋白ACE2復合物2.45埃的高分辨率晶體結構,準確定位了新冠病毒RBD和受體ACE2的相互作用位點,揭示了受體ACE2特異性介導新冠病毒細胞侵染的結構基礎,為治療性抗體藥物開發以及疫苗的設計奠定了堅實的基礎。

【37】2020年3月31日,北京師范大學田懷玉,北京市疾病預防控制中心楊瑞馥,英國牛津大學Oliver G. Pybus,Christopher Dye及普林斯頓大學Bryan T. Grenfell共同通訊在Science 在線發表題為“An investigation of transmission control measures during the first 50 days of the COVID-19 epidemic in China”的研究論文,該研究使用獨特的數據集,包括病例報告,人員流動和公共衛生干預措施,調查了COVID-19的傳播和控制情況。

【38】2020年4月4日,香港大學Chris K. P. Mok及克里普斯研究所Ian A. Wilson共同通訊在Science 在線發表題為“A highly conserved cryptic epitope in the receptor-binding domains of SARS-CoV-2 and SARS-CoV”的研究論文,該研究確定了CR3022的晶體結構(分辨率為3.1?),該抗體是先前從恢復期的SARS患者中分離出的中和抗體,與SARS-CoV-2刺突蛋白(S)的受體結合結構域(RBD)形成復合結構??偟膩碚f,這項研究提供了對SARS-CoV-2抗體識別的分子見解。

【39】2020年4月6日,中國科學院上海生化細胞所陳玲玲團隊在Cell 在線發表題為“Distinct Processing of lncRNAs Contributes to Non-conserved Functions in Stem Cells”的研究論文,該研究報告人類和小鼠胚胎干細胞(ESC)中lncRNAs的不同亞細胞定位。與mESCs相比,在hESCs的細胞質中定位的lncRNA的比例明顯更高。事實證明,這對于hESC多能性很重要。 這些發現表明,lncRNA加工和定位是功能快速發展的先前未被充分認識的因素。

【40】2020年4月8日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心辛秀芳與美國密歇根州立大學何勝洋共同通訊在Nature 在線發表題為“A plant genetic network for preventing dysbiosis in the phyllosphere”的研究論文,該研究構建了“人工合成微生物群”,并通過細菌16S rRNA基因和基因組測序、“無菌植物培養系統”等實驗明確了突變體植物的葉際微生群由“正?!弊優椤笆Ш馇覍χ参镉泻Α保╠ysbiotic)的狀態并導致葉片發生類似病害的表型。對植物微生物群穩態機制的研究可以幫助人們將來設計和改變植物微生物群落結構,從而改善植物生長和抗逆等性狀,為人類生產和生活服務。

【41】2020年4月8日,清華大學葛亮團隊在Cell 在線發表題為“A Translocation Pathway for Vesicle-Mediated Unconventional Protein Secretion”的研究論文,該研究發現了一條調節小泡進入和無信號肽貨物分泌的易位途徑。該研究將TMED10鑒定為許多無信號肽貨物分泌及囊泡進入的蛋白質通道。

【42】2020年4月8日,中國科學院上海神經所楊輝及周海波共同通訊在Cell 在線發表題為“Glia-to-Neuron Conversion by CRISPR-CasRx Alleviates Symptoms of Neurological Disease in Mice”的研究論文,該項研究通過運用最新開發的RNA靶向CRISPR系統CasRx特異性地在視網膜穆勒膠質細胞中敲低Ptbp1基因的表達,首次在成體中實現了視神經節細胞的再生,并且恢復了永久性視力損傷模型小鼠的視力。該研究將為未來眾多神經退行性疾病的治療提供一個新的途徑。

【43】2020年4月8日,,由浙江大學、青島大學、中國臺灣地區中國醫藥大學以及美國MD安德森癌癥中心合作,呂志民,洪明奇,Xu Daqian共同通訊在Nature雜志上在線發表了題為“The gluconeogenic enzyme PCK1 phosphorylates INSIG1/2 for lipogenesis”的研究論文,該研究顯示在人類肝細胞癌(HCC)細胞中激活的AKT在Ser90處磷酸化胞漿磷酸烯醇丙酮酸羧激酶1(PCK1)(糖異生中的限速酶)。該研究發現突出了PCK1的蛋白激酶活性在SREBPs激活,脂肪形成和HCC發生中的重要性。

【44】2020年4月8日,中國農科院哈爾濱獸醫研究所陳化蘭,步志高及中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所武桂珍共同通訊在Science 在線發表題為“Susceptibility of ferrets, cats, dogs, and other domesticated animals to SARS–coronavirus 2”的研究論文,該研究調查了雪貂和與人類密切接觸的動物對SARS-CoV-2的易感性。結果表明,新冠病毒在狗、豬、雞和鴨子中的復制能力很差,但在雪貂和貓身上能有效復制。該研究還發現,新冠病毒可通過呼吸道飛沫在貓之間傳播。目前仍不明確貓能否將病毒傳染給人類,因此貓主人尚無需恐慌。

【45】2020年4月9日,上??萍即髮W饒子和,楊海濤及中科院上海藥物所蔣華良共同通訊在Nature 在線發表題為“Structure of Mpro from COVID-19 virus and discovery of its inhibitors”的研究論文,該研究解析了新型冠狀病毒關鍵藥物靶點——主蛋白酶(Mpro)的高分辨率三維空間結構,并綜合利用三種不同的藥物發現策略,找到針對新冠病毒的潛在藥物。

【46】2020年4月10日,西安交通大學黃強,杜克大學Xiling Shen及麻省理工學院Rudolf Jaenisch共同通訊在Science在線發表題為“Intravital imaging of mouse embryos”的研究論文,該研究該研究開發了可植入的窗口,用于對從E9.5到出生的小鼠胚胎進行成像。 該可移動的活體窗口允許進行操作和高分辨率成像。 這項技術可以與各種組織操作和顯微鏡方法相結合,以前所未有的時空分辨率研究發育過程。

【47】2020年4月9日,山東農業大學孔令讓團隊在Science 發表題為“Horizontal gene transfer of Fhb7 from fungus underlies Fusarium head blight resistance in wheat”的研究論文,成功克隆了來源于長穗偃麥草的抗赤霉病主效基因Fhb7。

【48】2020年4月10日,清華大學饒子和,婁智勇及上??萍即髮W王權共同通訊在Science 題為“Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from COVID-19 virus”的研究論文,該研究報告了SARS-Cov-2輔助因子nsp7和nsp8與全長nsp12的cryo-EM結構,分辨率為2.9埃。

【49】2020年4月16日,廣東省疾病預防控制中心柯昌文(廣東省公共衛生研究院為第一單位)及牛津大學Oliver G Pybus共同通訊在Cell 在線發表題為“Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Guangdong Province, China ”的研究論文,該研究結合了宏基因組測序和平鋪擴增子方法,從廣東受感染的個體中產生了53個基因組。流行病學和系統發育分析相結合的結果表明,盡管由于大流行初期病毒遺傳變異低,但系統發育聚類尚不確定。該研究結果表明,假定的本地傳輸鏈的時間,規模和持續時間受到國家出行限制以及該省大規模密集監視和干預措施的約束。盡管取得了這些成功,但隨著從其他國家進口的病例數量的增加,仍需要在廣東進行COVID-19監視。

【50】2020年4月17日,浙江萬里學院葛楚天及杜克大學Blanche Capel等人在Science 在線發表題為“Temperature-dependent sex determination is mediated by pSTAT3 repression of Kdm6b”的研究論文,該研究建立了溫度與Kdm6b轉錄調控之間的因果關系。該研究顯示,信號轉導和轉錄激活因子3(STAT3)在溫暖的雌性產生溫度下被磷酸化,與Kdm6b基因座結合,并抑制Kdm6b轉錄,從而阻斷了雄性途徑。Ca2 +的流入(STAT3磷酸化的介體)在雌性溫度下升高,并充當STAT3激活的溫度敏感調節劑。

【51】2020年4月16日,NIBS的邵峰團隊在Science在線發表題為“Granzyme A from cytotoxic lymphocytes cleaves GSDMB to trigger pyroptosis in target cells”的研究論文,該研究報道自然殺傷細胞和細胞毒性T淋巴細胞通過細胞焦亡殺死gasdermin B(GSDMB)陽性細胞。這項研究建立了gasdermin介導的細胞焦亡作為一種殺傷淋巴細胞的細胞毒性機制,可以增強抗腫瘤免疫力。

【52】2020年4月16日,北京大學張澤民,申占龍,安進公司的 Xin Yu及Jackson G. Egen共同通訊在Cell 在線發表題為“Single-Cell Analyses Inform Mechanisms of Myeloid-Targeted Therapies in Colon Cancer”的研究論文,該研究對來自結直腸癌患者的免疫和基質細胞群進行了scRNA-seq分析,確定了特定的巨噬細胞和常規樹突狀細胞(cDC)亞群是腫瘤微環境中細胞串擾的關鍵介體。

【53】2020年4月22日,中國科學院上海藥物研究所柳紅/許葉春,上??萍即髮W楊海濤及中國科學院武漢病毒所張磊砢共同通訊在Science 在線發表題為”Structure-based design of antiviral drug candidates targeting the SARS-CoV-2 main protease“的研究論文,該研究設計并合成了兩種針對 Mpro的先導化合物(11a和11b)。兩者均表現出優異的抑制活性和有效的抗SARS-CoV-2感染活性。SARS-CoV-2 Mpro與11a或11b形成復合物的X射線晶體結構均以1.5分辨率測定,表明11a和11b的醛基共價鍵合到Mpro的Cys145。兩種化合物在體內均顯示出良好的PK特性,而11a的毒性也較低,表明這些化合物是有前途的候選藥物。

【54】2020年4月23日,上??萍即髮W,南開大學,清華大學,中科院生物物理所,伯明翰大學等多單位合作,饒子和,王權,李俊及Gurdyal S. Besra及共同通訊在Science 在線發表題為“Structures of cell wall arabinosyltransferases with the anti-tuberculosis drug ethambutol”的研究論文,該研究確定了分枝桿菌EmbA-EmbB和EmbC-EmbC配合物在其糖基供體和受體底物以及乙胺丁醇存在下的冷凍電子顯微鏡和X射線晶體結構。該研究工作為理解生化功能和抑制阿拉伯糖基轉移酶以及開發新的抗結核藥物提供了結構基礎。

【55】2020年4月24日,上??萍即髮WRaymond C. Stevens及密歇根大學Roger D. Cone共同通訊在Science 在線發表題為“Determination of the melanocortin-4 receptor structure identifies Ca2+ as a cofactor for ligand binding”的研究論文,該研究首次解析人源黑皮質素-4-受體(MC4R)與環形多肽配體SHU9119復合物2.8埃分辨率的晶體結構。該研究首次觀察到功能性Ca2+與GPCR的結合模式,發現Ca2+有助于穩定受體-候選藥物復合物,并使內源性激動劑α-黑素細胞刺激激素的親和力和效力得到了極大的提高。

【56】2020年4月25日,澳門科技大學,四川大學,清華大學,中山大學等多機構聯手合作,張康,王光宇,林天歆,何健行,李為民作為通訊在Cell在線發表題為“Clinically Applicable AI System for Accurate Diagnosis, Quantitative Measurements and Prognosis of COVID-19 Pneumonia Using Computed Tomography”的研究論文,該研究使用來自4154名患者的大型計算機斷層掃描(CT)數據庫,開發了可以診斷新冠肺炎并將其與其他常見肺炎和正常對照區分開的AI系統。AI系統可以幫助放射科醫生和醫生進行快速診斷,尤其是在醫療系統超負荷的情況下。該研究已經在全球范圍內提供了此AI系統,以協助臨床醫生應對COVID-19。

【57】2020年4月27日,武漢大學,復旦大學,香港科技大學,上海環境監測中心,香港中文大學等多機構合作,陳宇,藍柯,闞海東,伏晴艷,何建輝,寧治共同通訊在Nature 在線發表題為“Aerodynamic analysis of SARS-CoV-2 in two Wuhan hospitals”的研究論文,該研究結果表明,室內通風,開放空間,對防護服進行消毒以及對廁所區域的正確使用和消毒可以有效地限制氣溶膠中SARS-CoV-2 RNA的濃度。未來的工作應探索霧化病毒的傳染性。

【58】2020年4月29日, 清華大學祁海、上??萍即髮W胡霽、清華大學鐘毅共同通訊在Nature 在線發表題為“Brain control of humoral immune responses amenable to behavioural modulation”的研究論文,該研究發現了第一條由神經信號傳遞(非內分泌激素介導)的中樞神經對適應性免疫應答進行調控的解剖學明確的通路,該研究揭示了大腦對適應性免疫的控制,并提出了通過行為干預增強免疫能力的可能性。

【59】2020年4月29日,南方科技大學郭紅衛團隊在Nature 在線發表題為“Plant 22-nt siRNAs mediate translational repression and stress adaptation”的研究論文,該研究報告鑒定和表征一組由植物中的DICER-LIKE 2(DCL2)蛋白產生的內源性22個核苷酸的siRNA。該研究揭示了22個核苷酸的siRNA的獨特特性,并揭示了它們在植物適應環境脅迫中的重要性。

【60】2020年4月29日,復旦大學,湖南疾病預防控制中心,美國東北大學等多機構共同合作,余宏杰及Marco Ajelli共同通訊在Science 在線發表題為“Changes in contact patterns shape the dynamics of the COVID-19 outbreak in China”的研究論文,該研究提供了證據,表明在武漢和上海實施的干預措施以及由此產生的人類行為變化極大地減少了日常接觸,從根本上減少了與家庭互動的機會, 這大大減少了SARS-CoV-2的傳播?!?1】2020年4月29日,香港中文大學賈建民團隊在Nature 在線發表題為“Population flow drives spatio-temporal distribution of COVID-19 in China”的研究論文,該研究使用基于手機數據,開發了一個時空“風險源”模型,該模型利用人口流量數據不僅可以預測確診病例,而且可以在早期識別出高傳播風險地區。該模型產生了一個基準趨勢和一個指數,用于評估不同地區隨時間推移的COVID-19社區傳播風險。任何國家的政策制定者都可以使用這種方法來獲得可用數據,以進行快速,準確的風險評估,并在持續爆發之前計劃有限資源的分配。

【62】2020年5月1日,中科院上海藥物所徐華強,許葉春,浙江大學張巖及清華大學張抒揚共同通訊在Science 在線發表題為“Structural basis for inhibition of the RNA-dependent RNA polymerase from SARS-CoV-2 by remdesivir”的研究論文,該研究確定了SARS-CoV-2 RdRp復合物的自然形式或與模板引物RNA和抗病毒藥物Remdesivir的兩個冷凍EM結構。該結構為病毒RNA復制的工作機制提供了重要的見識,并為對抗病毒感染的藥物設計提供了合理的模板。

【63】2020年5月4日,復旦大學,南安普敦大學,武漢疾病預防控制中心,哈佛醫學院等多機構合作,賴圣杰,余宏杰及Andrew J. Tatem等人在Nature 在線發表題為”Effect of non-pharmaceutical interventions to contain COVID-19 in China“的研究論文,研究結果表明,中國采取的積極、強有力的綜合性非藥物性干預措施,在全國不同地區均取得顯著的防控效果,有效地阻斷了新型冠狀病毒的傳播,遏制了疫情的進一步擴散,為全球新冠病毒的防控爭取了寶貴的時間。各國應借鑒中國經驗,積極制定、采取并及時調整非藥物性干預策略,以最大程度地減少新型冠狀病毒肺炎對健康、社會和經濟的影響。

【64】2020年5月6日,中科院生物物理所薛愿超團隊在Nature 在線發表題為“RIC-seq for global in situ profiling of RNA–RNA spatial interactions”的研究論文,該研究通過將RNA結合蛋白介導的鄰近連接與深度測序偶聯,報道了一種用于分子內和分子間RNA-RNA相互作用的整體概況分析的RNA原位構象測序(RIC-seq)技術。該技術不僅概括了已知的RNA二級結構和三級相互作用,而且還促進了人類細胞中RNA的三維(3D)相互作用圖的生成。該研究證明了RIC-seq在發現RNA的3D結構,相互作用和調控作用方面的強大功能和適用性。

【65】2020年5月6日,中國醫學科學院秦川,浙江省疾病預防控制中心張嚴峻,科興控股生物技術有限公尹衛東,中國科學院生物物理研究所王祥喜,中國食品藥品檢定研究院李長貴及中國疾病預防控制中心盧金星共同通訊在Science在線發表題為”Rapid development of an inactivated vaccine candidate for SARS-CoV-2“的研究論文,該研究開發了純化的滅活SARS-CoV-2病毒候選疫苗(PiCoVacc),該疫苗可在小鼠,大鼠和非人類靈長類動物中誘導SARS-CoV-2特異性中和抗體。這些數據支持針對人類的SARS-CoV-2疫苗的快速臨床開發。

【66】2020年5月7日,華南農業大學肖立華,沈永義及廣州動物園陳武共同通訊在Nature 發表題為“Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins”的研究論文,該研究從馬來亞穿山甲中分離出的一種冠狀病毒在E,M,N和S基因中分別與SARS-CoV-2具有100%,98.6%,97.8%和90.7%的氨基酸同一性。特別地,穿山甲-CoV的S蛋白內的受體結合結構域實際上與SARS-CoV-2的受體結合結構域相同,具有一個非關鍵氨基酸差異。比較基因組分析的結果表明,SARS-CoV-2可能源自穿山甲-CoV-樣病毒與蝙蝠-CoV-RaTG13-樣病毒的重組。在分析的25種馬來亞穿山甲中有17種檢測到了穿山甲冠狀病毒。被感染的穿山甲顯示出臨床癥狀和組織學變化,并且抗穿山甲-CoV的循環抗體與SARS-CoV-2的S蛋白反應。穿山甲中與SARS-CoV-2高度相關的冠狀病毒的分離表明它們有潛力充當SARS-CoV-2的中間宿主。如果不能有效地控制野生動植物貿易,則新發現的冠狀病毒可能對公共健康構成威脅。

【67】2020年5月7日,北京協和醫學院秦川及中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所武桂珍共同通訊在Nature 在線發表題為“The pathogenicity of SARS-CoV-2 in hACE2 transgenic mice”的研究論文,該研究使用感染SARS-CoV-2的hACE2轉基因小鼠研究病毒的致病性。在感染SARS-CoV-2的hACE2小鼠中觀察到了體重減輕和病毒在肺中復制。典型的組織病理學是間質性肺炎,肺泡間質中大量淋巴細胞和單核細胞浸潤,肺泡腔內巨噬細胞聚集。在支氣管上皮細胞,肺泡巨噬細胞和肺泡上皮細胞中觀察到病毒抗原。在具有SARS-CoV-2感染的野生型小鼠(沒有轉hACE2的小鼠)中未發現該現象。該研究闡明了hACE2小鼠中SARS-CoV-2的致病性,并滿足了Koch的假設,該小鼠模型可促進針對SARS-CoV-2的療法和疫苗的開發。

【68】2020年5月7日,深圳市第三人民醫院張政,以色列魏茨曼科學研究所Ido Amit及法國巴斯德研究所Benno Schwikowski共同通訊在Cell 在線發表題為”Host-viral infection maps reveal signatures of severe COVID-19 patients“的研究論文,該研究介紹了一種稱為Viral-Track的新計算工具,該工具旨在使用直接映射策略系統地掃描生理病毒感染的scRNA-seq數據中的病毒RNA。該研究分析顯示,SARS CoV-2病毒對重癥患者的免疫系統具有巨大影響,與輕癥相比,發現SARS-CoV-2主要感染上皮和巨噬細胞亞群。此外,Viral-Track在其中一名重癥患者中檢測到人間肺炎病毒的意外合并感染。這項研究將Viral-Track建立為剖析病毒感染機制的廣泛適用工具,包括鑒定病毒誘發的病理學所涉及的細胞和分子特征。

【69】2020年5月13日,高福、高峰,劉磊及吳燕共同通訊在Science 上發表題為:A noncompeting pair of human neutralizing antibodies block COVID-19 virus binding to its receptor ACE2的研究論文。該研究發現了兩種人抗新冠病毒的單克隆抗體可以與細胞受體ACE2結合,并具有不同的抗原表位。小鼠實驗表明,這兩種抗體可以有效降低受感染小鼠肺部的新冠病毒滴度。這些研究結果強調了以抗體為基礎的治療方法應用于對抗COVID-19大流行的前景,并為合理的疫苗設計提供了結構基礎。

【70】2020年5月14日,香港大學Malik Peiris團隊在Nature 在線發表題為"Infection of dogs with SARS-CoV-2"的研究論文,該研究使用定量RT-PCR,血清學,病毒基因組測序以及在一只狗中分離出病毒,發現香港有十五只狗中的2只被SARS-CoV-2感染。證據表明,這是SARS-CoV-2人對動物傳播的實例。尚不清楚受感染的狗是否可以將病毒傳播給其他動物或傳播給人類。

【71】2020年5月14日,香港大學Hui-Ling Yen團隊在Nature 在線發表題為“Pathogenesis and transmission of SARS-CoV-2 in golden hamsters”的研究論文,該研究表明金色敘利亞倉鼠中的SARS-CoV-2感染類似于輕度感染人類的特征,這又增加一種動物模型進行研究新冠病毒的發病機理及致病機制。

【72】2020年5月17日,北京大學,首都醫科大學,軍事醫學科學院及協和醫學院聯手合作,謝曉亮,秦成峰,秦川及金榮華共同通訊在Cell 在線發表題為“Potent neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 identified by high-throughput single-cell sequencing of convalescent patients’ B cells”的研究論文,該研究表明可以通過高通量單B細胞測序有效地發現人中和抗體,以應對大流行性傳染病。

【73】2020年5月20日,上海交通大學陳賽娟,Wang Shengyue及復旦大學盧洪洲共同通訊在Nature 在線發表題為“Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19”的研究論文,該研究數據為病毒和宿主因素在疾病機制中發揮的各自作用提供了進一步的證據,并強調了早期干預治療的重要性。

【74】2020年5月20日,暨南大學劉兵,蘭雨及南洋理工大學Florent Ginhoux共同通訊在Nature 在線發表題為“Deciphering human macrophage development at single-cell resolution”的研究論文,該研究從Carnegie第11至23階段的人類胚胎中分離了CD45 +造血細胞,并通過單細胞RNA測序對它們進行了轉錄組分析,然后對 CD45+CD34+CD44+ 卵黃囊來源的髓樣偏向祖細胞進行功能表征( YSMPs)。該研究的數據代表了人類胚胎發生過程中早期巨噬細胞發育的時空動力學的全面表征,為人類TRMs的發育和功能的未來研究提供了參考。

【75】2020年5月21日,中科院武漢病毒所石正麗及楊興婁共同通訊在Cell 在線發表題為“Pathogenesis of SARS-CoV-2 in transgenic mice expressing human angiotensin-converting enzyme 2”的研究論文,該研究成功開發了SARS-CoV-2 hACE2轉基因小鼠(在C3B6小鼠中為HFH4-hACE2)感染模型。感染的小鼠產生典型的間質性肺炎和病理,與COVID-19患者相似。病毒定量顯示肺是感染的主要部位,盡管在某些小鼠的眼睛,心臟和大腦中也可以發現病毒RNA。從感染的肺和腦組織中分離出全基因組序列中與SARS-CoV-2相同的病毒。最后,該研究表明預先暴露于SARS-CoV-2可以保護小鼠免受嚴重的肺炎的侵害??偠灾?,該結果表明,hACE2小鼠將成為測試潛在疫苗和治療劑的有價值的工具。

【76】2020年5月22日,上??萍即髮W饒子和、王權及中國科學院武漢病毒研究所龔鵬共同通訊在Cell 在線發表題為“Structural basis for RNA replication by the SARS-CoV-2 polymerase”的研究論文,該研究解析了RNA聚合酶及其輔助因子與RNA和抗病毒候選藥物瑞德西韋復合體2.9 ?的三維結構,揭示了新型冠狀病毒聚合酶復合體催化過程中“轉位前”和“轉位后”兩個生理狀態的構象特征。

【77】2020年5月26日,中國科學院微生物研究所,中國科學院武漢病毒研究所,首都醫科大學,安徽大學等多機構強力合作,高福,嚴景華,袁志明,王奇慧及王福生共同通訊在Nature 在線發表題為“A human neutralizing antibody targets the receptor binding site of SARS-CoV-2”的研究論文,該研究報告了從恢復期的COVID-19患者中分離出2種特異性人單克隆抗體(MAb)。CA1和CB6在體外對SARS-CoV-2具有強效的特異性中和活性。 此外,CB6在預防和治療方面均抑制了恒河猴的SARS-CoV-2感染。 進一步的結構研究表明,CB6識別與SARS-CoV-2受體結合域(RBD)中的血管緊張素轉化酶2(ACE2)結合位點重疊的表位,從而通過空間位阻和直接界面干擾病毒/受體相互作用, 該結果表明CB6值得進一步的臨床轉化研究。

【78】2020年5月26日,深圳第三人民醫院,南方科技大學,清華大學,廣州醫科大學等多機構強力合作,張政,王新泉及張林琦共同通訊在Nature 在線發表題為“Human neutralizing antibodies elicited by SARS-CoV-2 infection”的研究論文,該研究報告了來自8個SARS-CoV-2感染個體的單個B細胞的206 RBD特異性單克隆抗體的分離和表征。這些發現表明抗RBD抗體是病毒物種特異性抑制劑。此處鑒定的抗體可能是SARS-CoV-2臨床干預措施開發的候選抗體。

【79】2020年5月28日,溫州醫科大學,西湖大學等多機構合作(溫州醫科大學為第一單位),郭天南,陳海嘯等人共同通訊在Cell 在線發表題為“Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera”的研究論文,該研究對46個COVID-19和53個對照個體的血清進行了蛋白質組學和代謝組學分析??傊?,該研究揭示了重癥COVID-19患者血清中特征性蛋白質和代謝產物的變化,可用于選擇潛在的血液生物標志物以進行嚴重程度評估。

【80】2020年6月6日,北京生物制品研究所有限責任公司,中國疾病預防控制中心,北京協和醫學院及北京大學等多單位合作,高福,秦川,譚文杰,婁智勇,李長貴,武桂珍,徐苗及楊曉明共同通訊在Cell 在線發表題為“Development of an inactivated vaccine candidate, BBIBP-CorV, with potent protection against SARS-CoV-2”的研究論文,該研究報告了滅活的SARS-CoV-2疫苗候選物(BBIBP-CorV)的中試規模,該疫苗在小鼠,大鼠,豚鼠,兔和非人類靈長類動物(食蟹猴和獼猴)中誘導高水平的中和抗體滴度 ,提供針對SARS-CoV-2的保護。 使用2μg/劑量的BBIBP-CorV進行的兩次劑量免疫為獼猴提供了針對SARS-CoV-2氣管內攻擊的高效保護,而沒有可檢測到的抗體依賴性增強感染。 此外,BBIBP-CorV對疫苗生產顯示出高效率和良好的遺傳穩定性。 這些結果支持在臨床試驗中進一步評估BBIBP-CorV。

【81】2020年6月10日,廣州醫科大學趙金存,愛荷華大學Stanley Perlman及Paul B. McCray Jr.共同通訊在Cell 在線發表題為“Generation of a Broadly Useful Model for COVID-19 Pathogenesis Vaccination, and Treatment”的研究論文,該研究通過復制缺陷型腺病毒(Ad5-hACE2)外源遞送人ACE2開發了小鼠模型??傊?,該研究描述了一種具有廣泛和直接實用性的鼠模型,以研究COVID-19的發病機理,并評估新的療法和疫苗。

【82】2020年6月11日,中國科學院遺傳發育研究所李家洋及王冰共同通訊在Nature 在線發表題為“Transcriptional regulation of strigolactone signalling in Arabidopsis”的研究論文,該研究使用合成的獨腳金內酯鑒定了擬南芥中的401 獨腳金內酯響應基因,并顯示這些植物激素主要通過轉錄激活BRANCHED 1,TCP DOMAIN蛋白質1和ANTHOCYANIN PIGMENT 1來調節枝條,葉片形狀和花色苷積累基因。該研究發現SMXL6靶向擬南芥基因組中的729個基因,并通過直接與其啟動子結合來抑制SMXL6,SMXL7和SMXL8的轉錄,表明SMXL6作為一種自動調節的轉錄因子,可維持獨腳金內酯信號的穩態。這些發現揭示了一種意想不到的機制,激素信號傳導的轉錄阻遏物可通過該機制直接識別DNA并調節高等植物中的轉錄。

【83】2020年6月11日,中山大學宋爾衛及蘇士成共同通訊在Nature 在線發表題為“DNA of neutrophil extracellular traps promotes cancer metastasis via CCDC25”的研究論文,該研究顯示。NETs在乳腺癌和結腸癌患者的肝轉移中富集,而血清NETs可以預測早期乳腺癌患者肝轉移的發生。研究人員將跨膜蛋白CCDC25識別為癌細胞上的NET-DNA受體,該受體可感知細胞外DNA,并隨后激活ILK-β-parvin途徑來增強細胞運動性。臨床上,顯示CCDC25在原發性癌細胞上的表達與患者預后差有關??傮w而言,該研究描述了介導NET依賴性轉移的跨膜DNA受體,并建議靶向CCDC25可能是預防癌癥轉移的有吸引力的治療策略。

【84】2020年6月11日,中山大學黃炳培及倫敦瑪麗皇后大學Kairbaan M. Hodivala-Dilke共同通訊在Cell 在線發表題為“Cancer Burden Is Controlled by Mural Cell-β3-Integrin Regulated Crosstalk with Tumor Cells”的研究論文,該研究表明壁細胞通過丟失β3-整合素表達,從而通過FAK-HGFR-Akt-NF-κB途徑增強信號傳導并增加CCL2介導的旁分泌信號,可以通過腫瘤細胞富集的MEK1和ROCK2信號來增加腫瘤負荷, 不影響腫瘤血管數量或功能的途徑??偠灾?,壁細胞不是簡單的血管支持細胞,而是通過β3-整聯蛋白,可以通過壁細胞衍生的旁分泌信號調節腫瘤的生長。研究數據為壁細胞β3-整合素的作用提供了原理證明,并闡明了腫瘤生長控制的機制。

【85】2020年6月17日,Cell 雜志在線發表了來自中科院遺傳發育所田志喜/梁承志課題組合作題為“Pan-Genome of Wild and Cultivated Soybeans”的研究論文。該研究公布了大豆的泛基因組,有助于促進大豆的進化和功能基因組學研究。

【86】2020年6月2號,中山大學的李勃興實驗室和紐約大學的Richard W. Tsien(錢永佑)實驗室共同通訊在Cell 在線發表文章“Neuronal Inactivity Co-opts LTP Machinery to Drive Potassium Channel Splicing and Homeostatic Spike Widening”,發現了興奮性穩態可塑性的分子機制,為這個假說環路提供了完整的實證。

【87】2020年6月22日,軍事醫學科學院,西湖大學及清華大學聯手合作,陳薇,周強及李建民共同通訊在Science 在線發表題為“A neutralizing human antibody binds to the N-terminal domain of the Spike protein of SARS-CoV-2”的研究論文,該研究從十名恢復期的COVID-19患者中分離并鑒定了單克隆抗體(mAb)。 從這些研究中獲得的信息可用于開發針對SARS-CoV-2的基于結構的疫苗設計。

【88】2020年6月23日,南方醫科大學徐洋、加州大學舊金山分校王磊及中國科學院理化技術研究所杭州研究院王謙共同通訊(南方醫科大學為第一單位)在Cell 在線發表題為“Developing Covalent Protein Drugs via Proximity-Enabled Reactive Therapeutics”的研究論文,該研究報告了一種接近啟用反應性療法(PERx)的方法來產生共價蛋白藥物。PERx應該提供一種通用平臺技術,用于將各種相互作用的蛋白質轉化為共價結合物,實現針對生物學研究的特定共價蛋白質靶向,以及常規非共價蛋白質藥物無法達到的治療能力。

【89】2020年6月25日,上海交通大學第九人民醫院雷鳴及武健共同通訊在Science 在線發表題為“Structural insight into precursor ribosomal RNA processing by ribonuclease MRP”的研究論文,該研究介紹了釀酒酵母RNase MRP全酶及與包含A3切割位點的ITS1片段的復合物的冷凍電子顯微鏡(EM)結構。這些結構與生化研究相結合,揭示了蛋白質和RNA亞基的共同進化已將RNase MRP轉化為獨特的核糖核酸酶,該酶通過識別短而松散定義的共有序列來處理單鏈RNA。這種廣泛的底物特異性表明RNase MRP可能具有無數但未被識別的底物,這些底物可能在各種細胞環境中發揮重要作用。

【90】2020年6月28日,中國科學院,海南醫學院,協和醫學院等多單位合作,高福,秦川,嚴景華及戴連攀共同通訊在Cell 在線發表題為“A universal design of betacoronavirus vaccines against COVID-19, MERS and SARS”的研究論文,該研究描述了克服此限制的MERS-CoV RBD的二聚體形式。與常規單體形式相比,RBD-二聚體顯著提高了中和抗體(NAb)的效價,并保護了小鼠免受MERS-CoV感染。晶體結構顯示RBD-二聚體完全暴露了雙重受體結合基序,這是NAbs的主要靶標。結構指導的設計進一步產生了穩定的RBD-二聚體形式,即串聯重復單鏈(RBD-sc-二聚體),保留了疫苗效力。該研究推廣了這種策略來設計針對COVID-19和SARS的疫苗,從而將NAb滴度提高了10-100倍。RBD-sc-二聚體在中試規模生產中獲得了高產量,為進一步的臨床開發提供了支持。免疫原設計框架可以普遍應用于其他β-CoV疫苗,以應對新出現的威脅。

【91】2020年7月1日,上??萍即髮W劉志杰及華甜共同通訊在Nature 在線發表題為“Structural basis of CXC chemokine receptor 2 activation and signalling”的研究論文,該研究報告白細胞介素8(IL8,也稱為CXCL8)激活的人類CXC趨化因子受體2(CXCR2)與Gi蛋白復合的冷凍電子顯微鏡結構,以及設計的變構拮抗劑結合的CXCR2晶體結構。該研究結果揭示了CXCL8和CXCR2之間以及CXCR2–Gi蛋白相互作用的獨特的結合模式。對CXCR2的非活躍狀態和活躍狀態的進一步結構分析揭示了一個獨特的激活過程以及趨化因子受體的競爭性小分子拮抗作用。此外,本研究為內源性蛋白質分子如何激活G蛋白偶聯受體(GPCR)提供了新見解,這將有助于針對趨化因子系統的療法的合理開發,以獲得更好的藥理作用。

【92】2020年7月3日,中國醫學科學院醫學動物實驗研究所秦川團隊在Science 發表題為“Primary exposure to SARS-CoV-2 protects against reinfection in rhesus macaques”的研究論文,該結果表明,原發性SARS-CoV-2感染可以防止隨后的暴露,這對疾病的預后和疫苗設計具有重要意義。

【93】2020年7月9日,中國科學院上海藥物研究所譚敏佳、國家癌癥中心/中國醫學科學院腫瘤醫院肖汀、軍事科學院軍事醫學研究院、國家蛋白質科學中心(北京)賀福初、上海交通大學李婧以及軍事醫學研究院、國家蛋白質科學中心(北京)汪宜共同通訊在Cell 在線發表題為“Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma”的研究論文,該研究對103例中國患者的LUAD進行了全面的蛋白質組學分析。蛋白質組學,磷酸化蛋白質組學,轉錄組和全外顯子組測序數據的綜合分析顯示了癌癥相關的特征,例如腫瘤相關的蛋白質變體,獨特的蛋白質組學特征以及早期患者或具有EGFR和TP53突變的患者的臨床結局。該研究的綜合蛋白質組學分析可以更全面地了解LUAD的分子結構,并為更精確的診斷和治療提供機會。

【94】2020年7月15日,清華大學李海濤及耶魯大學醫學院Andrew Z. Xiao共同通訊在Nature 在線發表題為“N6-methyladenine in DNA antagonizes SATB1 in early development”的研究論文,該研究顯示N6-mA在早期發育的細胞命運轉變過程中,在改變表觀遺傳格局方面具有關鍵作用??傮w而言,該研究發現證明了SATB1通過N6-mA發揮功能的出乎意料的分子機制,并揭示了DNA修飾,DNA二級結構與早期胚胎發育中大染色質域之間的聯系。

【95】2020年7月17日,中國食品藥品檢定研究院王佑春及黃維金共同通訊在Cell 在線發表題為“The impact of mutations in SARS-CoV-2 spike on viral infectivity and antigenicity”的研究論文,該研究觀察了80個變體和26個糖基化位點的修飾性,以期對康復期患者的中和抗體和血清的感染性和反應性。D614G以及同時包含D614G和另一個氨基酸變化的幾個變體,更具感染性。大多數在受體結合結構域具有氨基酸變化的變體感染力較小,但包括A475V,L452R,V483A和F490L的變體對某些中和抗體產生抗性。此外,大多數糖基化缺失的感染性較小,而同時缺失N331和N343糖基化則大大降低了感染力,這表明糖基化對于病毒感染性的重要性。有趣的是,N234Q對中和抗體具有明顯的抗性,而N165Q變得更加敏感。這些發現可能對疫苗和治療性抗體的開發有價值。

【96】2020年7月16日,華中科技大學鄔堂春,王超龍及哈佛大學Xihong Lin共同通訊在Nature 在線發表題為“Reconstruction of the full transmission dynamics of COVID-19 in Wuhan”的研究論文,該研究基于32583例實驗室確診病例,使用建模方法在2020年1月1日至2020年3月8日的五個事件和干預標志的五個時期內重構了COVID-19的動態過程??紤]到癥狀前的傳染性,確診率,傳播率和人口流動,該研究確定了暴發的兩個關鍵特征:高隱蔽性和高傳播性。該研究估計在3月8日之前尚未確定感染的87%(下限為53%),可能包括無癥狀和輕度癥狀的病例。爆發初期的基本繁殖數R0為3.54,遠高于SARS和MERS。該研究觀察到多管齊下的干預措施對控制暴發,將繁殖指數減少到0.28,通過這些積極控制,截至在2020年3月8日,武漢市的新冠感染率下降達96%。這些結果為持續監控和干預以最終遏制COVID-19爆發提供了重要意義。

【97】2020年7月23日,中國科學院生物物理研究所及軍事醫學科學院等多單位合作,饒子和,王祥喜,秦成峰,王佑春及謝良志共同通訊在Science 在線發表題為“Structural basis for neutralization of SARS-CoV-2 and SARS-CoV by a potent therapeutic antibody”的研究論文,該研究報道了一種人源化單克隆抗體H014,通過與S受體結合域(RBD)結合,可有效中和SARS-CoV-2假病毒和SARS-CoV假病毒以及真實的SARS-CoV-2。重要的是,在hACE2小鼠模型中,H014的給藥可降低感染肺部的SARS-CoV-2滴度,并預防肺部感染。與H014 Fab片段復合的SARS-CoV-2 S三聚體的Cryo-EM表征揭示了一種新穎的構象表位,僅當RBD處于開放構象時才可接近。生化,細胞,病毒學和結構研究表明,H014阻止SARS-CoV-2附著于其宿主細胞受體??捎玫尼槍ARS-CoV和SARS-CoV-2的中和抗體的表位分析揭示了廣泛的交叉保護性表位。該研究結果突出了基于抗體的治療性干預措施在COVID-19治療中的關鍵作用。

【98】2020年7月22日,浙江大學張巖、中科院上海藥物研究所謝欣以及山東大學于曉和孫金鵬共同通訊在Nature 在線發表題為“Structural basis of GPBAR activation and bile acid recognition”的研究論文,該研究首次利用單顆粒冷凍電鏡重構技術解析了膽汁酸受體GPBAR在合成配體P395以及膽汁酸類似物INT-777作用下與Gs蛋白三聚體形成的復合物的高分辨率結構,闡明了GPBAR非經典激活機制以及受體第三個胞內環在受體激活中的重要功能;明確了GPBAR對兩親性配體的識別機制;揭示了GPBAR識別多種膽汁酸的指紋圖譜;鑒定了天然膽汁酸結合受體的別構位點;同時還探究了不同配體介導受體下游信號偏向性的結構基礎。因此本研究對肝腸軸的信號轉導機制研究,以及GPCR的激活過程等都將有廣泛的影響。

【99】2020年7月24日,美國桑福德·伯納姆·普雷比斯醫學發現研究所Sumit K. Chanda,香港大學袁國勇及Scripps研究所Arnab K. Chatterjee共同通訊在Nature在線發表題為"Discovery of SARS-CoV-2 antiviral drugs through large-scale compound repurposing"的研究論文,該研究建立了一個已知藥物庫,其中包含約12,000個臨床階段或FDA批準的小分子。該研究報告鑒定了抑制病毒復制的100個分子,其中包括21種表現出劑量反應關系的已知藥物。其中13種有效濃度可能與患者可達到的治療劑量相當,包括PIKfyve激酶抑制劑apilimod,半胱氨酸蛋白酶抑制劑MDL-28170,Z LVG CHN2,VBY-825和ONO 5334。發現MDL-28170,ONO 5334和apilimod拮抗人iPSC衍生的肺細胞樣細胞中的病毒復制,并且PIKfyve抑制劑在主要的人肺外植體模型中也顯示出抗病毒功效。由于在這項研究中鑒定出的大多數分子已經進入臨床,因此這些化合物的已知藥理學和人類安全性概況將有助于加速這些藥物用于COVID-19治療的臨床前和臨床評估。

【100】2020年7月23日,軍事醫學科學院,清華大學及中國食品藥品檢定研究院等多單位合作,秦成峰,王佑春及Ying Bo共同通訊在Cell 在線發表題為“A thermostable mRNA vaccine against COVID-19”的研究論文,該研究開發了脂質納米顆粒包裹的mRNA(mRNA-LNP),它編碼SARS-CoV-2的受體結合域(RBD)作為候選疫苗(稱為ARCoV)。肌內免疫ARCoV mRNA-LNPs在小鼠和非人類靈長類動物中引發了針對SARS-CoV-2的強大中和抗體以及Th1偏向的細胞反應。小鼠進行兩次劑量的ARCoV免疫可完全抵抗SARS-CoV-2小鼠適應株的攻擊。另外,ARCoV以液體制劑生產,可以在室溫下保存至少一周。目前正在1期臨床試驗中評估這種新型COVID-19 mRNA疫苗ARCoV。

【101】2020年7月22日,清華大學李海濤及威爾康奈爾醫學院Steven Z. Josefowicz共同通訊在Nature在線發表題為“Histone H3.3 phosphorylation amplifies stimulation-induced transcription”的研究論文,該研究表明H3.3S31,沿著小鼠巨噬細胞中快速誘導的基因以刺激依賴性方式被磷酸化(H3.3S31ph)。刺激反應性基因的這種選擇性標記直接與組蛋白甲基轉移酶SETD2結合,后者是活性轉錄機制的一個組成部分,并“彈出”延伸共抑制因子ZMYND11。該研究結果表明專用機制能夠實現涉及組蛋白變體H3.3的快速轉錄,其磷酸化以及染色質調節劑的募集和排出。

【102】2020年7月21日,香港大學Benjamin J. Cowling團隊在Science 在線發表題為"Serial interval of SARS-CoV-2 was shortened over time by nonpharmaceutical interventions"的研究論文,該研究的發現可以改善對傳動動態的評估,預測未來的發病率,并估計控制措施的影響。

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